Sob a direção do também médico Naomar Monteiro de Almeida Filho – único reitor a exercer dois mandatos depois de Edgard Santos – a Universidade deu início a uma reforma substancial que inicia no presente e redefine o seu futuro.
Com o Programa de Apoio a Planos de Expansão e Reestruturação das Universidades Federais (REUNI), a UFBA amplia a oferta de cursos de graduação e implementa uma reforma curricular profunda e abrangente, com a implantação do regime de ciclos na educação superior, articulado à expansão de vagas no atual, de progressão linear. Este modelo constitui o Programa UFBA Universidade Nova.
Amplamente discutida pela sociedade e pela comunidade acadêmica do país - a proposta Universidade Nova serviu para Ministério da Educação implantar o REUNI (que retorna como principal apoio institucional e financeiro do Programa). A transformação curricular dotou a UFBA de cursos de graduação interdisciplinares, flexíveis, abrangentes e articulados à pós-graduação.
O Bacharelado Interdisciplinar – a principal e mais imediata mudança é o Bacharelado Interdisciplinar, com três anos de duração, em quatro áreas do conhecimento: Humanidades, Artes, Tecnologias e Ciências, Saúde. Em 2009, foram 900 novas vagas (noturnas, na maior parte). Foram implantados 26 cursos ou turmas de cursos de graduação existentes, com turmas noturnas, aumentando as vagas em mais de 50%. Em 2010, a UFBA ofereceu 7.991 vagas para 112 cursos de graduação em cinco modalidades: Bacharelado, Formação Profissional Superior, Licenciatura (formação de professores da educação básica), Superior de Tecnologia e Bacharelado Interdisciplinar.
Compromisso Social – Com o UFBA Universidade Nova, a Instituição ratifica o salto de qualidade em direção ao futuro. A transformação acadêmica, começada em 2008, posicionou a UFBA como a primeira universidade brasileira com estrutura curricular compatível com regimes modulares de formação em ciclos, tal como ocorre em países avançados social, cultural e científicamente
Aumento da oferta de cursos e vagas – O vestibular/2009 ampliou em mais de 50% as vagas e implantou 18 cursos de graduação. Somente o Bacharelado Interdisciplinar teve 900 novas vagas, oferecidas, sobretudo, para cursos noturnos. No total, a Universidade ofereceu 6,5 mil vagas para 99 cursos em Formação Superior, Bacharelado, Licenciatura (formação de professores para a educação básica), Superior de Tecnologia e Bacharelado Interdisciplinar.
Até a integralização do projeto (a matrícula projetada só se cumprirá em cerca de dois anos), a meta, é pular do sétimo para o quarto lugar no ranking das universidades federais, com 38 mil matrículas em mais de 100 cursos de graduação. Para atender a demanda, há, atualmente, 1,5 mil novos professores e servidores concursados..
Ampliação da estrutura física – Em paralelo, está em curso a reestruturação física dos campi, segundo as diretrizes do Plano Diretor Físico e Ambiental (aprovado pelo Conselho Universitário). As unidades (faculdades, escolas e institutos) serão reunidas por áreas de afinidade denominadas Zonais, ligadas por corredores de circulação, dentro do conceito de parque ecológico, cujo acesso será a pé, pelo bio-bus e bicicletas. Serão implantadas estruturas de formação, como arenas multiuso, pavilhões de laboratórios, complexos de auditórios modulados, centro de idiomas e outros; e as atuais estão em reforma na estrutura física. São 59 novas edificações e intervenções físico-ambientais, com investimento de R$ 187 milhões. Dos quais, R$ 86 milhões da REUNI e R$20 milhões de emendas parlamentares; outras fontes (CT-Infra, FINEP, Petrobrás, governos estadual e municipais,) complementam o orçamento.
